Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms