Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL1Q5VZK9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms