Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYT6Q5T7P8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms