Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF3Q5SZQ8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms