Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms