Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC158Q5M9N0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms