Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms