Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms