Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL22Q53GT1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms