Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PKDCCQ504Y2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms