Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF212Q495C1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms