Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC27Q2M243 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms