Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q1T7F1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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