Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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