Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCBQ16585 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCBQ16585 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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