Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms