Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF2Q15853 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF2Q15853 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF2Q15853 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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