Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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VAMP3Q15836 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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VAMP3Q15836 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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VAMP3Q15836 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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VAMP3Q15836 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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VAMP3Q15836 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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VAMP3Q15836 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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