Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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