Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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