Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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