Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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RAB39AQ14964 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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RAB39AQ14964 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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RAB39AQ14964 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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RAB39AQ14964 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RAB39AQ14964 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RAB39AQ14964 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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RAB39AQ14964 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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RAB39AQ14964 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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