Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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