Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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