Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSTA3Q13630 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms