Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C1orf61Q13536 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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