Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RESTQ13127 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RESTQ13127 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RESTQ13127 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RESTQ13127 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RESTQ13127 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RESTQ13127 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RESTQ13127 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RESTQ13127 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RESTQ13127 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RESTQ13127 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RESTQ13127 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RESTQ13127 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RESTQ13127 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RESTQ13127 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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