Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TROQ12816 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TROQ12816 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TROQ12816 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TROQ12816 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TROQ12816 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TROQ12816 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TROQ12816 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TROQ12816 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TROQ12816 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
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