Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD3Q0VAK6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD3Q0VAK6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms