Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms