Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK18Q07002 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms