Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOX4Q06945 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOX4Q06945 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms