Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNG1Q06432 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms