Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GBE1Q04446 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms