Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRX6P78412 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX6P78412 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX6P78412 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX6P78412 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRX6P78412 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms