Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBB4BP68371 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBB4BP68371 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms