Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VBP1P61758 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VBP1P61758 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms