Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LUMP51884 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LUMP51884 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LUMP51884 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LUMP51884 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms