Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLK1P49759 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms