Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP2P42575 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP2P42575 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP2P42575 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP2P42575 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP2P42575 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP2P42575 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP2P42575 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP2P42575 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP2P42575 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP2P42575 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms