Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms