Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms