Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms