Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms