Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASTP20810 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASTP20810 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASTP20810 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASTP20810 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASTP20810 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASTP20810 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASTP20810 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASTP20810 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASTP20810 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASTP20810 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASTP20810 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASTP20810 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASTP20810 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASTP20810 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms