Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMY2BP19961 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms