Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPI1P17947 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPI1P17947 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPI1P17947 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms