Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEFHP12036 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEFHP12036 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms