Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP3O75154 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms