Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms